تأسست كلية العلوم منذ تأسيس الجامعة العربية الأمريكية عام 2000، حيث بدأت بمنح درجة البكالوريس في تخصصي الأحياء والتقنيات الحيوية والرياضيات والإحصاء.
وحالياً الكلية تمنح درجة البكالوريس في الأحياء والتقنيات الحيوية والكيمياء والفيزياء والرياضيات والإحصاء. وأيضاً العديد من البرامج الفرعية في هذه التخصصات. بالإضافة إلى ذلك تمنح درجة الماجستير في الرياضيات التطبيقية والفيزياء.
جميع أقسام الكلية تطرح مساقات تأسيسية لطلبة كليات الطب والعلوم والهندسة والتجارة، كما تعزز الكلية التعاون بين الأقسام داخل الكلية من جهة وبين المؤسسات البحثية والتعليمية الوطنية والدولية من جهة أخرى.
كما أنها تسهل عملية توفير المعدات والوسائل المناسبة في جميع أقسام الكلية وذلك تعليم فعّال.